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Rapid and inexpensive V. cholerae Water Testing Method (2016)

Authors / Organizations: Pasteur, UNICEF

Year: 2016

Country: Guinea Bissau, République démocratique du CongoBénin


Comp et37The report enclosed is presenting the results of a field research led by the Institute Pasteur of Dakar and UNICEF teams to validate a protocol using Crystal VC Rapid Diagnostic Tests (already used for cholera detection in stools) to confirm the presence of toxigenic Vibrio cholerae in water samplings. Indeed, one shall advocate that the investigation of potential reservoirs of toxigenic V. cholerae should contribute significantly to improve surveillance and preparedness strategies. While a cholera outbreak, it is necessary to diligently identify potential source(s) of contamination.

The purpose of the project was to evaluate and implement during a cholera outbreak a simple, rapid, and inexpensive method that confirms presence of toxigenic V. cholerae in environmental water samples (surface water, wells, household water storage, etc.). During the 12 months of the project, 5 field trip missions in 3 different countries (Guinea-Bissau, Benin, and Republic Democratic of Congo) were organized. Overall, the 99 samples were collected and analyzed. Only 1 was positive for dipstick testing. It was from household water storage of a cholera patient admitted to the cholera center in Kalemie. Confirmations for every sample to the gold standard culture and PCR methods were done in the Institut Pasteur of Dakar to establish specificity and sensibility of the dipstick with this specific protocol.

The overall results of the project confirm the 100% specificity of the method. No false positive dipstick were accounted for. As only one positive dipstick over the 2 positive samples to toxigenic V. cholerae (one additional identified by PCR), the teams cannot conclude about the sensibility of this protocol. A more thorough discussion is accessible in this report.

Finally, this project concludes that this protocol shall bring new opportunities to the WASH actors, offering a rapid and inexpensive method to test potential presence of toxigenic Vibrio cholerae in water sources used by populations, knowing that there are almost never no water analyses done to confirm the presence or absence of V. cholerae while in an outbreak. The method is easy to implement, to use, and give a first result of the water quality in 24h in the field directly.

Le rapport présenté ci-dessous rassemble les résultats d’une recherche terrain conduite par l’Institut Pasteur de Dakar et les équipes UNICEF pour valider un protocole permettant la détection du Vibrio cholerae toxigénique dans des prélèvements d’eau en utilisant des Tests de Diagnostic Rapide -TDR- (NdR : TDR déjà utilisé lors de la détection en cas de suspicion de choléra dans les selles). En effet, d’aucun ne pourrait argumenter que l’investigation des réservoirs potentiels du V. cholerae toxigénique peut contribuer de manière importante à améliorer la surveillance et les stratégies de préparation au risque. Pendant une épidémie de choléra, il est notamment judicieux d’identifier diligemment les sources potentielles de contamination.

Le but de ce projet était d’évaluer et mettre en œuvre, pendant une épidémie de choléra, une méthode rapide, simple et à bas coût pour confirmer la présence du V. cholerae toxigénique dans les échantillons d’eau environnementales (eau de surface, puits, stockage d’eau à domicile, etc.) Pendant les 12 mois de projet, 5 missions terrains ont été organisées dans 3 pays différents (Guinée Bissau, Bénin et la République Démocratique du Congo). Au total, 99 échantillons ont été collectés et analysés. Seul un échantillon s’est révélé positif par TDR. Il provenait d’un stockage d’eau à domicile, domicile d’un patient à Kalemie. Les confirmations de chaque échantillon ont été faites par rapport à la culture gold standard et par PCR ; ces confirmations ont été effectuées par l’institut Pasteur pour établir la spécificité et la sensibilité de ce protocole.

Les analyses ont donc confirmé une spécificité à 100% de la méthode comme aucun TDR faux positif n’a été enregistré. En revanche, elles n’ont pas pu conclure sur une mesure de la sensibilité comme seule 1 TDR positif a été constaté sur 2 échantillons positifs au V. cholerae (un échantillon supplémentaire identifié par PCR). Le rapport présente une analyse complète des résultats.

Enfin, le projet conclut que le protocole peut offrir de nouvelles opportunités intéressantes aux acteurs WASH, mettant à disposition une méthodologie rapide et à bas coût pour tester la présence du vibrion dans les échantillons d’eau, car à ce jour, rares sont les situations où des analyses d’eau sont faites pour confirmer la présence ou l’absence de la bactérie et ainsi affiner la compréhension des voies de contamination. La méthode est facile de mise en œuvre, d’utilisation et donne un premier résultat dans les 24h. 

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